南寧住房公積金管理中心成立于1993年9月8日，前身為廣西首府南寧住房資金管理中心，隸屬于南寧市住房制度改革委員會辦公室的自收自支事業(yè)單位。2003年11月1日，根據(jù)《住房公積金管理條例》（國務(wù)院令第350號）和《國務(wù)院關(guān)于進一步加強住房公積金管理的通知》（國發(fā)〔2002〕12號）的文件精神，經(jīng)南寧市人民政府批準，在廣西首府南寧住房資金管理中心的基礎(chǔ)上，對包括縣住房資金管理中心的機構(gòu)和人員進行重組后，成立南寧住房公積金管理中心（簡稱“管理中心”），是直屬于南寧市人民政府的不以營利為目的的獨立的參照公務(wù)員法管理的正處級事業(yè)單位。

管理中心下設(shè)機辦公室、人事教育科、財務(wù)會計科、歸集管理科、貸款管理科、政策法規(guī)科、審計稽核科、信息管理科、服務(wù)管理科、關(guān)黨委十個機關(guān)科室和興寧、江南、青秀、西鄉(xiāng)塘、邕寧、良慶、武鳴、橫州、賓陽、上林、馬山、隆安十二個管理部。2006年8月南寧住房公積金管理中心區(qū)直分中心成立，隸屬于自治區(qū)人民政府辦公廳。2008年3月，管理中心接管南寧鐵路住房公積金管理機構(gòu)，成立南寧住房公積金管理中心鐵路分中心（簡稱“鐵路分中心”）。鐵路分中心作為管理中心的分支機構(gòu)，規(guī)格相當(dāng)于正處級，內(nèi)設(shè)綜合科、歸集管理科、貸款管理科、財務(wù)會計科及南寧、柳州、桂林、玉林四個管理部。管理中心對鐵路分中心、管理部實行“四統(tǒng)一”（統(tǒng)一決策、統(tǒng)一管理、統(tǒng)一核算、統(tǒng)一規(guī)章制度）管理。

管理中心的主要職責(zé)是：擬定并組織實施住房公積金具體管理辦法；編制并組織執(zhí)行住房公積金年度預(yù)（決）算；負責(zé)住房公積金歸集、提取、貸款、核算、政策咨詢等管理工作。

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